| ۱ | روشی برای پیاده سازی الگوها در ترکیب وب سرویس ها و انتخاب بهینه ترکیب با ساختار احتمالی | نرجس ظهیری,سید مرتضی بابامیر | محاسبات نرم | شهریور 1400 |
| ۲ | استخراج قوانین از توصیف و مدلسازی آنها با استفاده از شبکههای فازی پتری رنگی | مینا چاوشی,سید مرتضی بابامیر | محاسبات نرم | آبان 1401 |
| ۳ | Hybrid based QoS-aware selection of web services compositions | نرجس ظهیری,سید مرتضی بابامیر | Future Generation Computer Systems | 2025-07-12 |
| ۴ | A pattern-based and multi-objective architecture for selecting optimal compositions of web services | نرجس ظهیری,سید مرتضی بابامیر | Expert Systems with Applications | 2025-06-20 |
| ۵ | Quality‑aware web service composition using a hybrid summarization | نرجس ظهیری,سید مرتضی بابامیر | The Journal of Supercomputing | 2025-03-18 |
| ۶ | A Pattern and Summarization Based Optimization Algorithm to QoS-Aware Web Service Composition Selection | نرجس ظهیری,سید مرتضی بابامیر | Journal of AI and Data Mining | 2025-03-18 |
| ۷ | An Evolutionary Algorithm to Predict Super Secondary Structures of Proteins from Secondary Ones, A Case Study: β-LACTAMAZE Enzyme | شیما امیرصدری,سید مرتضی بابامیر,شهریار عرب | Journal of cell and molecular research | 2024-12-07 |
| ۸ | An Evolutionary Algorithm to Predict Super Secondary Structures of Proteins from Secondary Ones, A Case Study: β-LACTAMAZE Enzyme | سید مرتضی بابامیر,شیما امیرصدری,شهریار عرب | Journal of cell and molecular research | 2024-12-07 |
| ۹ | A Petri Net Based Flexible Model for Reasoning and Behavior Modeling of Event-Based Systems | مینا چاوشی,سید مرتضی بابامیر | محاسبات نرم دانشگاه کاشان | 2024-11-04 |
| ۱۰ | Modeling and Simulation of Fuzzy-rule Based WBAN using Multi-level Fuzzy Colored Petri-nets and Reinforcement Learning | N.Majma and S.M.Babamir | Journal of Computational Science | 2024-10-10 |
| ۱۱ | Reserve policy‑aware VM positioning based on prediction in multi‑cloud environment | E.Kholdi, S.M.Babamir | The Journal of Supercomputing | 2024-07-22 |
| ۱۲ | Anomaly Detection of Policies in Distributed Firewalls using Data Log Analysis | A.Andalib and S.M.Babamir | The Journal of Supercomputing | 2024-06-29 |
| ۱۳ | A hybrid energy‑aware algorithm for virtual machine placement in cloud computing | M.Yousofi and S.M.Babamir | Computing | 2024-04-03 |
| ۱۴ | Fuzzy Colored Petri Nets-Based Method to Analyze and Verify the Functionality of Software | M.Chavoshi and S.M.Babamir | CAII transactions on intelligent technology | 2023-10-16 |
| ۱۵ | Anomaly Detection of Policies in Distributed Firewalls using Data Log Analysis | A.Andalib and S.M.Babamir | The Journal of Supercomputing | 2023-05-29 |
| ۱۶ | Using a process algebra interface for verification and validation of UML statecharts | S. Doostali, S.M. Babamir, and M.Javani | Computer Standards and Interfaces | 2023-03-09 |
| ۱۷ | A METHOD TO SIMPLIFY PATTERNS WITH PROBABILISTIC STRUCTURE IN WEB SERVICE COMPOSITION | نرجس ظهیری,سید مرتضی بابامیر | مجله محاسبات نرم دانشگاه کاشان | 2022-12-13 |
| ۱۸ | A METHOD TO SIMPLIFY PATTERNS WITH PROBABILISTIC STRUCTURE IN WEB SERVICE COMPOSITION | نرجس ظهیری,سید مرتضی بابامیر | A METHOD TO SIMPLIFY PATTERNS WITH PROBABILISTIC STRUCTURE IN WEB SERVICE COMPOSITION | 2022-12-13 |
| ۱۹ | A Novel Two-Step Classification Approach for Runtime Performance Improvement of Duplicate Bug Report Detection | بهزاد سلیمانی نیسیانی,سید مرتضی بابامیر | The journal of Computer and Knowledge Engineering (CKE) | 2022-11-22 |
| ۲۰ | A Novel Two-Step Classification Approach for Runtime Performance Improvement of Duplicate Bug Report Detection | بهزاد سلیمانی نیسیانی,سید مرتضی بابامیر | The journal of Computer and Knowledge Engineering (CKE) | 2022-11-22 |
