نوسانات وزیکول ‌لیپیدی مدلی از پوشش ویروس کووید-۱۹ در اثر افزایش دما با استفاده از شبیه‌سازی دینامیک مولکولی درشت‌دانه

Abstract

اغلب ویروس‌ها دارای غشا هستند ویروس کووید-19 از جمله آنها است. با استفاده از وزیکو‌ل‌های لیپیدی می توان غشای دولایه لیپیدی ویروس‌ها را مدل‌سازی کرد. این غشاها به شدت به حرارت حساس هستند انبساط و نوسانات گرمایی پوشش لیپیدی دو عامل برای ایجاد تنش در پوشش ویروس هستند و بنابراین تجزیه و تحلیل کمی افزایش نوسانات وزیکول‌های لیپیدی در اثر افزایش دما که منجر به پارگی این غشاها و در نتیجه نابودی ویروس شود، حائز اهمیت است. در این تحقیق با استفاده از روش شبیه‌سازی دینامیک مولکولی درشت‌دانه تأثیر افزایش دما روی پایداری وزیکول‌ متشکل از هفت ‌لیپید که مدلی از پوشش ویروس کووید-19 است، بررسی شد و با نوسانات وزیکول تک‌لیپید در اثر افزایش دما مقایسه گردید. با افزایش دما مشاهده شد که شعاع وزیکول تک‌لیپیدی افزایش می‌یابد که با توجه به انبساط گرمایی قابل توجیه است و نشان‌دهنده تمایل آن به واپاشی در زمان‌های طولانی‌تر است. اما برخلاف وزیکول تک‌لیپیدی شعاع وزیکول هفت‌لیپیدی با افزایش دما کاهش می‌یابد. همچنین با افزایش دما نرخ فلیپ-فلاپ در دو نوع وزیکول افزایش می‌یابد ولی در وزیکول هفت‌لیپیدی سرعت رخ دادن این پدیده بسیار بیشتر است که نقش لیپیدهای متنوع خود می‌تواند عاملی برای کاهش شعاع و افزایش نرخ پدیده فلیپ-فلاپ در وزیکول هفت لیپیدی باشد.