CV
QR


Zahra Rezvani

Zahra Rezvani

Assistant Professor

College: Faculty of Chemistry

Department: Cell and Molecular Biology

Degree: Ph.D

CV
QR
Zahra Rezvani

Assistant Professor Zahra Rezvani

College: Faculty of Chemistry - Department: Cell and Molecular Biology Degree: Ph.D |

بررسی بیوانفورماتیکی پلی‌مورفیسم‌های ژن CHD8 به‌عنوان ژن پرخطر در اختلال طیف اوتیسم (ASD)

Authorsویدا برزیان,زهرا رضوانی
Journalمجله دانشکده پزشکی دانشگاه علوم پزشکی مشهد
IFثبت نشده
Paper TypeFull Paper
Published At1404/06/15
Journal GradeScientific - research
Journal TypeElectronic
Journal CountryIran, Islamic Republic Of
Journal IndexIranMedex ,ISC

Abstract

مقدمه: اختلال طیف اوتیسم (ASD) Autism spectrum disorder یک اختلال عصبی رشدی است که روی ارتباطات اجتماعی، تعاملات و رفتار افراد تأثیر می‌گذارد. ASD یک اختلال واحد نیست بلکه ترکیبی از عوامل ژنتیکی و محیطی نقش دارند. ژن‌های مرتبط با ASD عمدتا پروتئین‌هایی را کد می‌کنند که در ساختار و عملکرد سیناپسی، تکثیر سلولی، و تنظیم رونویسی نقش دارند. هدف این بررسی ارائه خلاصه‌ای از جهش‌های مربوط به ژن‌ CHD8 که مرتبط با ASD است. روش‌کار: این مطالعه با استفاده از 5 ابزار بیوانفورماتیکی (SIFT، Polyphen-2 ،HOPE ، Panther و Provean)، جهش‌های مضر در ژن CHD8 را بررسی کرده است. اطلاعات مربوط به SNP از dbSNP و توالی پروتئین از NCBI و Unoprot جمع‌آوری شده و برای پیش‌بینی پایداری پروتئین، از ابزار I-Mutant استفاده شده است. نتایج: با توجه به آنالیز بیوانفورماتیکی انجام شده بر روی ژن CHD8، ازبین 500 جهش شناخته شده در این ژن فقط 11 جهش در تمامی سرورهای (ابزارهای) آنالیز مضر پیش‌بینی شده بودندکه به صورت نمودار آماری مورد تحلیل و بررسی قرار گرفتند. بحث و نتیجه‌گیری: تحلیل ژن CHD8، 34 SNPخطرناک را نشان داد که 11 مورد آنها به عنوان مضرترین شناخته شدند. از بین آنها، SNP rs372717272 (جهش P791L) عنوان مضرترین جهش شناسایی شد که به شدت محافظت شده و بر پایداری پروتئین تاثیرگذار است.