ارزیابی تنوع ژنتیکی Gypsophila vaccaria (L.) Sm. (میخکیان) با استفاده از داده‌های توالی (internal transcribed spacer ۲ (ITS ۲

Abstract

روش مولکولی برای بررسی روابط میان گونه‌های گیاهی ارجحیت دارد؛ داده‌های هم‌ستیزانه‌ای پیرامون روابط گونه‌های میخکیان وجود دارد و همینک Vaccaria hispanica با Gypsophila vaccaria هم‌معنا به شمار می‌آید. توالی‌های internal transcrbed spacer 2 (ITS 2) از ۱۴ نمونه در پیوند با G. vaccaria و یک توالی از همان توالی DNA در Gypsophila elegans به‌عنوان برون‌گروه از پایگاه دادۀ NCBI به دست آمد؛ سپس این توالی‌ها با Bioedit ver.7.7.1 هم‌تراز شده و با بهره از MEGA ver.11.0.13 ارزیابی شدند. درخت فیلوژنتیک با استفاده از بیشترین بهینگی (MP) به نگارش در آمد. بر پایۀ این درخت، دو گروه از G. vaccaria از یکدیگر جدا شده و هر دوی آن‌ها با ارزش بوت‌استرپ بالای ۹۵٪ پشتیبانی شدند؛ اگرچه هیچ همبستگی‌ معناداری میان تنوع ژنتیکی و موقعیت جغرافیایی جمعیت‌های مختلف نبود. این ارزیابی نشان داد که G. vaccaria به‌عنوان یک گروه تک‌تبار با یک ارزش بوت‌استرپ بالا پشتیبانی نمی‌شود.