Evaluation of Prokaryotic Diversity in Hypersaline Environment by Culture-independent Method

AuthorsFereshteh Jookar Kashi, Parviz Owlia, Mohammad Ali Amoozegar
JournalModares Journal of Biotechnology
Paper TypeFull Paper
Published At۰-۰-۰۱
Journal GradeScientific - research
Journal TypeElectronic
Journal CountryIran, Islamic Republic Of
Journal IndexISC

Abstract

میکروارگانیسم ها علاوه بر محیط های معمولی در محیط های افراطی هم حضور دارند. دریاچه های نمک با شوری در حد اشباع در سراسر جهان پراکنده اند. یکی از این محیط های پرشور دریاچه ارومیه است. این دریاچه بزرگترین سطح آبی کشور و یکی از دریاچه های فوق شور در جهان، در شمال غربی ایران است که شبیه دریای پر شورGreat در آمریکاست. در این تحقیق از مناطق مختلف دریاچه ارومیه نمونه برداری شد و ماده ژنومی استخراج شده از نمونه آب شاخص به عنوان الگو برای تکثیر قطعه 16SrDNA و قطعه ای از ژن bop از طریق واکنش زنجیره ای پلی مراز (PCR)مورد استفاده قرار گرفت. با استفاده از روش کلونینگ هر یک از قطعات تکثیر شده که مربوط به یک سویه منفرد هستند با استفاده از کیت T/A وکتور Fermentase تکثیر یافتند. کتابخانه ژنی آرکی ها متعلق به 5 جنس Halonotius، Halolamina،Haloquadratum ،Halomicroarcula و Halorhabdus بودند. کتابخانه کلون های باکتریایی نیز در 4 راسته Bacteroidetes، Cyanobacteria، Actinobacteria و Firmicutes قرار داشتند. کلون های کتابخانه قطعه ای از ژن bop (به عنوان یک مارکر ملکولی) متعلق به 4 جنس Halorubrum، Natrialba، Haloquadratum و Natrinema بودند. برای بررسی بیشتر تنوع زیستی هالوآرکی ها به موزات بررسی 16S rDNA، تنوع زیستی ژن bop نیز مطالعه شد. این پژوهش نشان داد که فیلوژنی bop با فیلوژنی16S rDNA رابطه تنگاتنگی دارد. نتایج این پژوهش مشابه با سایر گزارش های موجود در مورد محیط های پرشور بررسی شده است.