بررسی اثر جهش Gly۱۷۳۸در دُمین BRCTو تغییر درساختار پروتئین( BRAC۱رویکرد بیوانفورماتیکی)

نویسندگانپرستو عارضی,زهرا رضوانی
همایشچهاردهمین کنگره سراسری بیوشیمی ایران
تاریخ برگزاری همایش۲۰۱۶-۸-۱۶
محل برگزاری همایشتهران
نوع ارائهسخنرانی
سطح همایشملی

چکیده مقاله

سرطان پستان یکی از شایع ترین بدخیمیها درکشورهای در حال توسعه است بهطوریکه امروزه از هر هشت زن ایرانی یک نفر مبتلا به سرطان پ ستان می شود. سرطان پ ستان میتواند به صورت پراکنده و یا ارثی رخ دهد. در نوع ارثی ژنهای بسیاری دخیلاند که BRCA1و BRCA2ازجمله مهمترین آنها است. BRCA1از سه دُمین تشکیل شده که دُمین BRCTبا توجه به نق شی که در واکنشهای ف سفریلا سیون ایفا میکند اهمیت ب سزایی در عملکرد پروتئین دارد بهطوریکه امروزه گزارشهای زیادی در رابطه با جهش در این ناحیه و بروز سرطان ارائه شده ا ست. در نتیجه برر سی جهشهای این ناحیه از پروتئین BRCA1اهمیت زیادی دارد. مواد و روشها با توجه به مطالعات انجام شده بر روی زنان مبتلا به سرطان پستان در جمعیت ایران، ابتدا جهشهای شایع ژن BRCA1 در این جمعیت مورد برر سی قرار گرفت، سپس تغییر Gly1738Gluتنها جهش گزارش شده در ناحیه BRCTدر زنان مبتلا در ایران انتخاب شد، سپس پیش بینی تغییر عملکرد و ساختار پروتئین با ا ستفاده از PolyPhen-2و Phyre-2 بررسی شد. در نهایت پس از انتخاب ساختار مناسب از پایگاه PDBو ایجاد جهش Gly1738Gluبا نرمافزار ،SPDBV دینامیک مولکولی با استفاده از نرم افزار گرومکس بررسی شد. یافتهها باتوجه به نتایج حاصل از PolyPhen-2و Phyre-2و همچنین بررسی نمودارهای RMSF،RMSDو dsspبرای هر دو سججاختار جهش یافته و نرمال و مشججاهدهی عدم تطابق بین نمودارها در ناحیهی جهش یافته و همچنین ناحیه مربوط به اسید آمینههای 1811تا 1851متوجه تغییراتی در ساختار دوم و سوم پروتئین شدیم. بحث و نتیجهگیری از آنجایی که تغییر در ساختار دوم و در نهایت ساختار سوم باعث تغییر در عملکرد پروتئین می شود، بنابراین تغییرات م شاهده شده در ساختار BRCA1جهش یافته، بیانگر تغییر در عملکرد این پروتئین میبا شد. با توجه به اهمیت این پروتئین دربازآرایی شک ست دور شتهای DNAو کنترل چرخهی سلولی، جهش Gly1738Gluبه عنوان یک جهش پاتوژن که باعث بروز سرطان پستان میشود، شناخته شده است