| ۱ | روشی برای پیاده سازی الگوها در ترکیب وب سرویس ها و انتخاب بهینه ترکیب با ساختار احتمالی | نرجس ظهیری,سید مرتضی بابامیر | محاسبات نرم | شهریور 1400 |
| ۲ | استخراج قوانین از توصیف و مدل‌سازی آن‌ها با استفاده از شبکه‌های فازی پتری رنگی | مینا چاوشی,سید مرتضی بابامیر | محاسبات نرم | آبان 1401 |
| ۳ | یک روش ترکیبی اندازه های مرکزیت و خواص زیستی برای بهبود تشخیص کمپلکس های پروتئینی در شبهکه PPI وزنی | عبدالکریم الهی,سید مرتضی بابامیر | مجله انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی | 2019-06-16 |
| ۴ | یک رویکرد عامل گرا با قابلیت یادگیری برای کنترل و بهبود عملکرد دستگاه تنظیم ضربان قلب بر بستر ابر | نگار مجمع,سید مرتضی بابامیر,محمد حسین منجمی | مهندسی برق و مهندسی کامپیوتر ایران | 1396/12/20 |
| ۵ | یک روش مبتنی بر دامنه برای شبیه¬سازی ناظر در کنترل نظارتی سیستم¬های گسسته | سید مرتضی بابامیر | سیستم های هوشمند در مهندسی برق | 1391/06/19 |
| ۶ | A Petri Net Based Flexible Model for Reasoning and Behavior Modeling of Event-Based Systems | مینا چاوشی,سید مرتضی بابامیر | محاسبات نرم دانشگاه کاشان | 2024-11-04 |
| ۷ | Modeling and Simulation of Fuzzy-rule Based WBAN using Multi-level Fuzzy Colored Petri-nets and Reinforcement Learning | N.Majma and S.M.Babamir | Journal of Computational Science | 2024-10-10 |
| ۸ | Reserve policy‑aware VM positioning based on prediction in multi‑cloud environment | E.Kholdi, S.M.Babamir | The Journal of Supercomputing | 2024-07-22 |
| ۹ | Anomaly Detection of Policies in Distributed Firewalls using Data Log Analysis | A.Andalib and S.M.Babamir | The Journal of Supercomputing | 2024-06-29 |
| ۱۰ | A hybrid energy‑aware algorithm for virtual machine placement in cloud computing | M.Yousofi and S.M.Babamir | Computing | 2024-04-03 |
| ۱۱ | Fuzzy Colored Petri Nets-Based Method to Analyze and Verify the Functionality of Software | M.Chavoshi and S.M.Babamir | CAII transactions on intelligent technology | 2023-10-16 |
| ۱۲ | Anomaly Detection of Policies in Distributed Firewalls using Data Log Analysis | A.Andalib and S.M.Babamir | The Journal of Supercomputing | 2023-05-29 |
| ۱۳ | Using a process algebra interface for verification and validation of UML statecharts | S. Doostali, S.M. Babamir, and M.Javani | Computer Standards and Interfaces | 2023-03-09 |
| ۱۴ | A METHOD TO SIMPLIFY PATTERNS WITH PROBABILISTIC STRUCTURE IN WEB SERVICE COMPOSITION | نرجس ظهیری,سید مرتضی بابامیر | مجله محاسبات نرم دانشگاه کاشان | 2022-12-13 |
| ۱۵ | A METHOD TO SIMPLIFY PATTERNS WITH PROBABILISTIC STRUCTURE IN WEB SERVICE COMPOSITION | نرجس ظهیری,سید مرتضی بابامیر | A METHOD TO SIMPLIFY PATTERNS WITH PROBABILISTIC STRUCTURE IN WEB SERVICE COMPOSITION | 2022-12-13 |
| ۱۶ | A Novel Two-Step Classification Approach for Runtime Performance Improvement of Duplicate Bug Report Detection | بهزاد سلیمانی نیسیانی,سید مرتضی بابامیر | The journal of Computer and Knowledge Engineering (CKE) | 2022-11-22 |
| ۱۷ | A Novel Two-Step Classification Approach for Runtime Performance Improvement of Duplicate Bug Report Detection | بهزاد سلیمانی نیسیانی,سید مرتضی بابامیر | The journal of Computer and Knowledge Engineering (CKE) | 2022-11-22 |
| ۱۸ | CP-PGWO: multi-objective workflow scheduling for cloud computing using critical path | سعید دوست علی,سید مرتضی بابامیر,مریم عینی کلشتری | CLUSTER COMPUT | 2021-07-03 |
| ۱۹ | Query processing optimization in broadcasting XML data in mobile communications | محسن شکرریز,سید مرتضی بابامیر,مقداد میرابی | J SUPERCOMPUT | 2021-06-09 |
| ۲۰ | Federated Geo-Distributed Clouds: Optimizing Resource Allocation Based on Request Type Using Autonomous and Multi-objective Resource Sharing Model | فاطمه عبادی فرد,سید مرتضی بابامیر | Big Data Research | 2021-01-15 |